首先给大家介绍一下基因芯片的概念，基因芯片是运用微缩技术把核酸密集有序地排列固定在固相平面载体预先设置的区域内，形成微型的检测器件，将待测样本标记后同芯片进行杂交，通过特定的手段获取信息，在此基础上检测对应片段是否存在和存在量的多少。
简单说一下，最成功的的典型基因芯片是在介质表面有序排列的DNA点阵，因此狭义的基因芯片又叫DNA微阵列。
基因芯片的发展和应用是在人类基因组的计划推动下应运而生的，其涉及领域较广。
在应用过程中，对于基因芯片所反映的信息迫切的需要被发现，因此，基因芯片的数据分析就显得极其重要。
数据分析简单来说就是对芯片的高密度杂交点阵图像进行处理并从中提取杂交点的荧光强度信号进行定量分析，在此基础上，通过有效数据的筛选和相关基因的聚类，最终整合杂交点的生物学信息，发现基因之间的相关联系或可能存在的联系。
利用软件进行分析的前提是必须知道其数据的特性，芯片数据的挖掘就是一个大前提，它有许多方法，包括图像分析、标准化问题、差异基因确定、聚类分析及基因功能注释等，在之后的学习中会陆续提到，大家可以提前了解哟。
关于基因芯片的应用可以分为两大类：特定基因的定性检测和基因表达的分析，这里的基因表达的分析是指基因表达的量的分析。
基因芯片具有更高的探针密度，允许设置足够多的对照探针以及更小的杂交体积。
简单的数据分析类型主要包括阈值确定、灰度值区间设定等。
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