公元1274年，忽必烈有意征服日本王国，元朝派遣了军队3.23万人穿越朝鲜半岛，乘坐九百艘大型战舰从半岛合浦渡过日本海，登陆了对马岛与壹岐岛。日本王国遭到了元军大举侵略，执政的镰仓幕府坚决不投降，日本武士英勇抵抗元军的入侵，史称为“元日战争”。
登陆沿海
公元1268年，忽必烈要求日本王国像高丽一样来朝通好（向元朝称臣），否则将对日本岛动武。当时执政日本岛的镰仓幕府以“书辞无理”为由，拒绝了向元朝称臣，并积极准备战争，加强了九州沿海要地的兵力部署，两国大战一触即发。
公元1274年10月3日，征东元帅忻都率领军队3.23万人东征，从半岛合浦渡过鲸海，舰队航行六日后，九百艘大型战舰登陆了对马岛与壹岐岛。元军在登陆作战中，大元骑兵并没有发挥重大作用，因为海战并不适合骑兵登陆与运输战马，反而是元朝步兵打开了战争局势，大规模步兵集团战术与火药武器沉重打击了驻守日军，在沿海诸岛全歼了数百名日本武士。
翌日，元军登陆了博多湾，驻守这里的日本将领“藤原经资”率兵奋力抵抗元朝入侵，双军短兵相接时，利刃碰撞声此起彼伏，海滩上横尸遍野，两军激烈厮杀数时，鲜血飞溅染红了大海。最终，日本将领“藤原经资”无力抵挡攻势，被元军所击败，日本武士撤退至太宰府水城，日本王国处于不利局面。
根据《日蒙古型皮铠本史书》记载称：“击鼓鸣锣，杀声震天。日军战马惊恐不安，跳跃打转，当武士拨转马头冲向敌人的时候，已经被敌人射中。蒙古矢短，但矢根涂有毒液，射上即中毒。敌数百人箭射如雨，长柄矛可刺进铠甲缝隙。元军排列成队，有逼近者，中间分开，两端合围，予以消灭。元军甲轻、善骑马，力大，不惜命，豪勇自如，善于进退。大将据高处指挥，进退击鼓，按鼓声行动。在后退时，铁炮中装铁弹，随着火焰喷出，四面烈火，烟气弥漫；其声凄厉，心碎肝裂，目眩耳聋，不辩东西，被击毙者极多。激战至暮，日军撤至太宰府水城”。
九州大战
紧接着，元军发动了对九州岛腹地的攻势，遭到了日军的坚决抵抗。大元骑兵难以在崎岖山地冲锋陷阵，日军正是看中了这点，选择在山坡地形决战。长枪武士战斗意志极强，数次击退了元军的进攻，双方杀得血流成河，山地四周可见尸体。元朝步兵大量使用火药武器震天雷（从宋朝学习的科技），威力巨大无比，被炸死者极多。
两军力战数日，征东副元帅刘复亨中箭受伤，元军被迫停止了强攻山地，撤退至停泊在沿海的战舰上休整，结果当天夜上意外刮起了台风，200多艘大型战舰被摧毁沉没，元军死伤极其惨重，因台风侵袭损失了1.3万士兵，全军士气低落，征东元帅忻都只得下令班师回朝，日本武士艰难地打退了元朝入侵。
“会夜大风雨，战舰触岩崖多败”。
公元1275年，忽必烈再次派遣使者，要求日本王国来朝通好（向元朝称臣），镰仓幕府坚决不投降，下令将元朝使者杜世忠与何文著斩首示众，由此拉开了第二次元日战争。公元1281年，忽必烈非常愤怒，立即动员14万大军准备第二次东征，兵分两路进攻日本王国，第一支军队由征东元帅忻都指挥，率领4万元军穿越朝鲜，从半岛合浦渡过鲸海。另一支军队由元将范文虎指挥，率领10万元军从庆元（浙江）启程，出动大型战舰三千五百艘，穿越东海远征日本岛。
征东元帅忻都麾下的4万军队率先出发，元朝舰队随即攻克了对马岛，驻守岛上的日本武士顽强抵抗，但因寡不敌众，最终全部战死沙场。元军占领对马岛后，大肆烧杀劫掠，将整座岛夷为平地，随后元朝舰队南下入侵博多湾。
神风降临
自从上一次元朝入侵后，日本王国在博多湾修建了一道长十余公里的石坝，防垒石墙高六尺厚一丈，博多湾海滩上四处可见防垒，用以阻挡元朝海军的大举入侵。元朝舰队进入博多湾后，征东元帅忻都才发现沿海有石坝防线，海军难以登陆作战，征东元帅忻都只得另选其他海滩作为登陆点。
七日晨，元军从志贺岛登陆沿海，遭到岛上据守的日本武士顽强阻击，两军连日交锋，展开了激烈的海滩争夺战。由于日本武士擅长单打独斗，武士刀更是削铁如泥，给予元军造成了重大损失，死伤千余人。元军登陆作战不利，征东元帅忻都放弃强攻，元军由志贺岛撤退，舰队转而驶向壹岐岛。
另一方面，元军在壹岐岛取得了突破，与日军激战两日后，全歼数千余人，击杀了日军副指挥官“少贰资时”与指挥官“少贰资能”，日本武士大败而归，元军在岛上建立了临时营地。然后，元军继续尝试登陆其他沿海沙滩，皆遭到日军的顽强阻击，石墙防线坚不可摧，弓箭手以石墙为掩体射击，数次击退了元军的攻势，箭矢多如雨水一般，中箭者死伤时痛苦哀嚎，元军死伤极其惨重。
七月份，元将范文虎麾下的10万大军抵达了日本沿海，两路大军会师后，元朝军势大振，准备大举进攻大宰府水城。突然间，一场持续两天的巨大台风袭来，也就是日本非常有名的“神风”，台风瞬间摧毁了元朝舰队，无数的元军跌落大海里，士卒损失大半以上，台风给予元军造成了致命一击。
关于元军舰队总是被台风摧毁的原因，是因为元朝在高丽王国施行高压统治，以至于高丽人非常反感建造船只，所以故意建造了一些假冒伪劣船只交付给元军，再加上元朝将领对于航海一无所知，所以元朝海军总是被台风掀翻。
台风发生后，元军溺死者众多，物资损失严重，士气跌落千丈。元将范文虎下令收集各路残部，开始启程出海撤退，但仍然有大量元军被遗弃在鹰岛上。日本王朝认为暴风雨是神风显灵，日军纷纷自发祈神天佑，然后日本武士对鹰岛上的元军残部展开了大规模总攻，由于日军在人数上占据压倒性优势，很快击破了元军的各个防御据点，杀得溃不成军，将鹰岛上的元军压缩至栋原与中川原之间的一片狭小区域，直至全部消灭殆尽。
双方在鹰岛上的血战，都阵亡了大量的士卒，最终以日本武士惨胜告终。被俘虏的元军有3万余人，日本王国下令汉人俘虏免死，沦为日本人的奴隶，其余俘虏则斩首示众，以此威慑元朝入侵。恼怒的元帝忽必烈计划第三次东征日本王国，但由于元朝国内的种种原因，远征终究未能实现，直至忽必烈逝世。
