目前生产上推广的抗虫棉都是转基因抗虫棉，是外源Bt基因等导入棉花体内后经选育而成，因此与常规棉相比具有以下不同特点：
棉花种植常识中杂交棉与常规棉有以下区别：杂交棉是通过两种不同基因型的品种交而其后代是杂合体，中只能应用种一代，其二分离，不可再用年年都要制种。而常规棉其基因型是纯合稳定的，可以续种繁殖。产量也高。
杂交棉综合了父母本的优劣基因的互补或者优势基因的累加，表现出苗期长势强、出叶速度快、整齐一致，叶片数 多；植株较高，果枝较长，果枝数和果节数多，生物产量高 等构成产量基础的一些指标均较常规棉优良，因此杂交棉的产量一般较常规棉增产显著，朽代可使棉花皮棉亩产提高 10%〜20%,应用杂交棉2可使皮棉亩产提高5%〜10%, 具有超亲优势。
但杂交棉易早衰，防止杂交棉早衰的主要对策有：①正确选择品种。选择适应本地区气候条件的省审和国审的抗病虫并且后期生长势强的品 种。②适期播种。长江流域以4月中旬为宜。③注重施壮桃肥6 采用测土配方施肥，合理施肥，施肥原则上要配合使用农家肥、 有机肥和微肥，施足底肥，早施、重施花铃肥，注重施壮桃肥和 后期补喷叶面肥，延长功能叶的寿命，利于大桃的形成和高产。④防旱排渍，要开好三沟，遇旱浇水，逢渍必排。⑤加强病虫害 防治。
一、营养生长势稍弱
棉花植株体内的外源抗虫基因在其表达过程中，对自身的内源激素的含量与分布产生了较大的影响，导致抗虫棉生长点赤霉素含量下降，分布减少，因此在同等条件下抗虫棉的营养生长势不及常规棉。在生产上表现为植株略矮、株型较紧凑、叶片稍小等。实际表现为果枝多，叶枝少。当然果枝和叶枝生长主要受温度影响，低温长叶枝，高温长果枝。如2017年棉花果枝多，叶枝少而短；而2016年表现为叶枝长的旺！
二、对某些气候因素较为敏感
近几年的研究表明，抗虫棉特别是常规抗虫棉(非杂交棉)对高温较为敏感，在高温条件下花粉败育或授精不良，导致蕾铃大量脱落或棉铃较小、畸形等；部分抗虫棉品种则对水分较为敏感，抗湿性较差，在生产上表现为根系发育不良，后期易早衰。实现表现为杂交抗虫棉受高温影响，纤维短而粗，马克隆值偏高现象，如2015年和2017年杂交棉产区棉花品质表现。
三、对钾营养需求较高
近几年实践表明，抗虫棉对钾的需求大于常规棉，在同等条件下比常规棉高20%左右。因此，如钾肥投入不足，造成棉花发育不良、蕾铃脱落增加、铃重和品质下降，缺钾严重的导致棉花脱叶早衰。杂交抗虫棉表现为缺钾，红叶早衰，尤其是恶劣天气的影响，8月中下旬如遇低温、大雨或风灾的影响，极有可能发生零星红叶至点片红叶早衰现象。
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